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广州市微生物研究所是广州市科学技术局直属科研机构，主要从事微生物发酵、生物、食品添加剂、防霉防虫和食用菌等领域的技术研究与产品开发，经认定批准为广州市。
2011年，全国地表水总体为轻度污染，湖泊(水库)富营养化问题仍然较**，长江、黄河、珠江、松花江、淮河、海河、辽河、浙闽片河流、西南诸河和内陆诸河水系监测的469个国控断面中，Ⅰ~Ⅲ类、Ⅳ~Ⅴ类和劣Ⅴ类水质断面比例分别为61.0%、25.3%和13.7%，主要污染指标为化学需氧量、五日生化需氧量和总磷，其中又以海河、淮河、松花江和辽河等地表水污染较其他水系污染严重。同时，在2011年监测的26个国控重点湖泊(水库)中，Ⅰ~Ⅲ类、Ⅳ~Ⅴ类和劣Ⅴ类水质的湖泊(水库)比例分别为42.3%、50.0%和7.7%，主要污染指标为总磷和化学需氧量。
生活污水：指居民在日常生活活动中产生的废水，主要是生活废料和人的排泄物，其中包括厨房洗涤、淋浴、洗衣等废水以及冲洗厕所的污水。
工业废水：是指工业生产过程中排放出来的废水。由于工业类型、原料、生产工业以及用水水质和管理水平的差异，各种工业废水的成分和性质千变万化、有的含大量**物质，有的含大量重金属等无机物。有的生物毒性较大，有的物理性质十分恶劣。
工业用水检测项目：
（1）微生物：菌落总数、大肠菌群、霉菌、酵母菌、沙门氏菌、志贺氏菌、大肠埃希氏菌、副溶血性弧菌、金葡萄球菌、溶血性链球菌、产气夹膜梭菌、蜡样芽孢、单核增生李斯特氏菌、军团菌、霍乱弧菌、阪崎肠、空肠弯、铜绿假单胞菌、肠球菌等
（2）感官性状：色度、浑浊度、臭和味、肉眼可见物等
（3）物理指标：PH值、电导率、总硬度、溶解性总固体、挥发酚、阴离子合成洗涤剂等
（4）综合指标：耗氧量、生化需氧量、总**碳等
（5）金属元素：铍、铅、镉、铬、汞、、钾、钙、钠、镁、磷、铁、、硒、锌、锡、锰、钴、镍、碘、钒等
（6）无机非金属：盐、氯化物、氯酸盐、亚氯酸盐、氟化物、硝酸盐氮、硫化物、磷酸盐、硼、氨氮、亚硝酸盐、碘化物、溴酸盐等
（7）**物：苯、、、双酚A、、、一氯二、二氯一、三氯乙烯、四氯乙烯、三、邻苯二甲酸二（2-乙基已基）酯等
广州市微生物研究所三十多年来承担各类科研项目120多项，先后有30多个科研项目获得省、部和市级的奖励。广州工业微生物检测中心，机构设置在广州市微生物研究所内，主要从事工业产品的微生物检测工作，具有国家实验室认可(CNAL)和计量认证(CMA)二合一认证。
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